Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPAQ9P0L0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms