Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD3Q9P035 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms