Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNK4Q9NYG8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms