Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms