Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL1Q9NSC2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms