Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMMDC1Q9NPL8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms