Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB9BQ9NP90 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB9BQ9NP90 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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