Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPM3Q9HCF6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPM3Q9HCF6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms