Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms