Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms