Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms