Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms