Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms