Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC9Q96Q05 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms