Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms