Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms