Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms