Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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