Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ZNF548Q8NEK5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms