Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms