Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC21AQ8NDW8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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