Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS8Q8N3P4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS8Q8N3P4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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