Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC71Q8IV32 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms