Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms