Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XAF1Q6GPH4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XAF1Q6GPH4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms