Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SAMD13Q5VXD3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SAMD13Q5VXD3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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