Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCAF6Q58WW2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms