Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms