Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms