Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms