Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms