Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF6Q330K2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF6Q330K2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms