Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTN1Q16799 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTN1Q16799 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms