Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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