Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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NEDD8Q15843 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NEDD8Q15843 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NEDD8Q15843 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NEDD8Q15843 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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