Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SS18Q15532 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms