Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHBQ15464 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHBQ15464 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms