Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms