Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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