Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GAPVD1Q14C86 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAPVD1Q14C86 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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