Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN1Q14699 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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