Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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