Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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