Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms