Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
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