Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE3BQ13370 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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