Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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AP3B2Q13367 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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AP3B2Q13367 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AP3B2Q13367 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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