Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
STRN3Q13033 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STRN3Q13033 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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