Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms