Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms